Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpc2Q9R244 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpc2Q9R244 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms