Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms