Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psma4Q9R1P0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms