Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4eQ9R0Q8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms