Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AmfrQ9R049 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms