Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf4Q9QZS2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf4Q9QZS2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms