Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp21Q9QZL6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp21Q9QZL6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms