Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms