Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma6Q9QUM9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms