Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms