Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk1eQ9JMK2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms