Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfmbt1Q9JMD1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms