Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms