Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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SacsQ9JLC8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SacsQ9JLC8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms