Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsmQ9JL96 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms