Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gde1Q9JL56 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gde1Q9JL56 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms