Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk3aQ9JKX8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk3aQ9JKX8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms