Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx5Q9JKQ4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms