Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmod2Q9JKK7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Tmod2Q9JKK7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod2Q9JKK7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms