Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cyp39a1Q9JKJ9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms