Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms