Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gfra4Q9JJT2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gfra4Q9JJT2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gfra4Q9JJT2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms