Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl3Q9JJR7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms