Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms