Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riox1Q9JJF3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms