Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl28Q9JIL2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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