Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb1Q9JIF7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb1Q9JIF7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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