Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtaQ9JHK4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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