Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz2Q9JHH9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz2Q9JHH9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz2Q9JHH9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz2Q9JHH9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz2Q9JHH9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz2Q9JHH9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz2Q9JHH9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copz2Q9JHH9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz2Q9JHH9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms