Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms