Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13bQ9ET35 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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