Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Sp6Q9ESX2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp6Q9ESX2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms