Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SelenofQ9ERR7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SelenofQ9ERR7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SelenofQ9ERR7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms