Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap29Q9ERB0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms