Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clstn2Q9ER65 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms