Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4aQ9ER60 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms