Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndst3Q9EQH7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms