Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r172Q9EPS4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r172Q9EPS4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms