Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn1Q9EPL2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms