Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms