Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan4Q9DCK3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms