Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trmt112Q9DCG9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms