Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms