Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hmg20aQ9DC33 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmg20aQ9DC33 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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