Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc97Q9DBT3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms