Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy3Q9DAU1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy3Q9DAU1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms