Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim23Q9DAL0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim23Q9DAL0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms