Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmtm2bQ9DAC0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms