Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem239Q9DA47 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem239Q9DA47 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms