Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd9Q9D9M4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
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